登海种业主要控股股东为莱州市农业科学院持股比例为 53.19%;其次为李登海，持股比例为 7.33%。李登海又通过持有莱州市农业科学院 82.99%的股份成为登海种业的实际控制人。
公开简介显示，李登海，1949年9月出生，山东省莱州市后邓村人，大专学历，研究员，享受国务院特殊津贴专家，现任登海种业党支部书记、名誉董事长，国家玉米工程技术研究中心(山东)主任。公开信息显示，李登海直接持有登海种业6，451.28万股，占股比例为7.33%。据《2020胡润百富榜》，李登海身价高达100亿元人民币，排在第594位。
